本草基因组学作为中草药研究的热点领域，在中药现代化发展中发挥着重要作用。本书作者长期工作在本草基因组学研究一线，结合各自研究工作介绍了本草基因组学的主要研究内容及其应用。本书第一章至第八章为基础篇，包括概述、结构基因组学、转录组学、功能基因组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学和宏基因组学等；第九章至第十五章为应用篇，包括药用模式生物、中药合成生物学、基因组辅助育种、 DNA鉴定、中药体内代谢基因组研究、关键实验技术和生物信息学及数据库等。